Skip to main content

Table 1 Slide-to-slide IHC staining variation of the 10 multi-tissue control samples, based on IA output variables.

From: Digital immunohistochemistry platform for the staining variation monitoring based on integration of image and statistical analyses with laboratory information system

SampleID 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
N 69 69 69 69 69 69 69 69 69 69
Mean           
Total Nuclei 2111 1006 859 1175 458 496 928 587 3059 120
Positive Nuclei 1436 541 310 400 74 89 122 111 2436 25
Percent Positive Nuclei 68 55 36 35 19 19 14 20 79 23
Positive Density 1462 895 752 616 285 270 250 373 1810 262
Negative Nuclei 674 464 550 775 384 406 806 476 623 95
Negative Density 694 749 1320 1160 1306 1178 1615 1504 464 882
Area of Analysis 0,97 0,60 0,41 0,66 0,26 0,32 0,50 0,31 1,34 0,09
Brown Intensity 110 138 133 126 174 174 171 163 106 183
Blue Intensity 167 171 170 170 173 172 170 170 171 179
Intensity Brown/Blue Ratio 0.66 0.81 0.78 0.74 1.01 1.01 1.01 0.96 0.62 1.03
Blue Area 0.10 0.12 0.13 0.18 0.18 0.18 0.20 0.14 0.12 0.09
Brown Area 0.36 0.22 0.07 0.09 0.05 0.05 0.05 0.04 0.61 0.02
Standard deviation           
Total Nuclei 527 454 275 380 423 393 487 377 524 162
Positive Nuclei 408 235 96 112 71 79 74 73 515 28
Percent Positive Nuclei 5 5 3 3 7 7 4 5 4 8
Positive Density 178 84 66 66 85 111 65 84 334 118
Negative Nuclei 164 232 183 273 357 326 422 310 106 136
Negative Density 103 148 136 102 321 244 214 233 74 290
Area of Analysis 0,22 0,24 0,13 0,21 0,22 0,22 0,27 0,19 0,07 0,10
Brown Intensity 3.61 4.83 5.85 5.32 2.51 3.03 2.27 4.61 5.80 2.98
Blue Intensity 3.21 2.86 3.50 2.75 3.27 3.99 4.08 4.35 2.53 3.51
Intensity Brown/Blue Ratio 0.02 0.03 0.04 0.04 0.02 0.02 0.03 0.04 0.03 0.02
Blue Area 0.03 0.02 0.03 0.04 0.04 0.04 0.03 0.03 0.02 0.08
Brown Area 0.12 0.09 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.10 0.02
Relative error           
Total Nuclei 0.25 0.45 0.32 0.32 0.92 0.79 0.52 0.64 0.17 1.35
Positive Nuclei 0.28 0.43 0.31 0.28 0.96 0.89 0.60 0.66 0.21 1.16
Percent Positive Nuclei 0.07 0.09 0.08 0.08 0.37 0.39 0.28 0.27 0.05 0.35
Positive Density 0.12 0.09 0.09 0.11 0.30 0.41 0.26 0.23 0.18 0.45
Negative Nuclei 0.24 0.50 0.33 0.35 0.93 0.80 0.52 0.65 0.17 1.42
Negative Density 0.15 0.20 0.10 0.09 0.25 0.21 0.13 0.15 0.16 0.33
Area of Analysis 0,22 0,39 0,31 0,31 0,84 0,69 0,53 0,61 0,06 1,14
Brown Intensity 0.03 0.04 0.04 0.04 0.01 0.02 0.01 0.03 0.05 0.02
Blue Intensity 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02
Intensity Brown/Blue Ratio 0.04 0.04 0.05 0.05 0.02 0.02 0.03 0.05 0.05 0.02
Blue Area 0.27 0.15 0.27 0.22 0.25 0.22 0.13 0.22 0.17 0.88
Brown Area 0.33 0.39 0.31 0.25 0.41 0.38 0.32 0.35 0.16 0.65